Celera Genomics lõpetab ühe inimolendi genoomi järjestamise faasi

Celera Genomics lõpetab ühe inimolendi genoomi järjestamise faasi
Celera Genomics lõpetab ühe inimolendi genoomi järjestamise faasi
Anonim

Ettevõte alustab hiire genoomi järjestamist

ROCKVILLE, MD – 6. aprill 2000 – PE Corporationi äriühing Celera Genomics (NYSE: CRA) teatas täna, et on lõpetanud ühe inimese genoomi järjestamise etapi ja hakkab nüüd järjestatud fragmente kokku panema. genoom oma õigesse järjekorda, mis põhineb uutel arvutuslikel edusammudel. Celera alustas inimese genoomi järjestamist seitse kuud tagasi, septembris 1999. Lisaks kokkupanekule keskendub ettevõte nüüd järjestusteabe märkimisele ja geneetiliste variatsioonide kohta lisaandmete kogumisele.

Celera kogu genoomi haavliga järjestamise tehnika hõlmab sekveneerimist kaheahelalise kloonitud DNA mõlemast otsast. Celera täpselt seotud klooni lõppjärjestused on võtmetööriist genoomi palju täielikumaks kokkupanemiseks, kui üheahelalised sekveneerimismeetodid võimaldavad võrreldaval järjestuse katvuse tasemel. Celera paaristatud lõpp-sekveneerimise strateegia, mis on osa kogu genoomi haavliga järjestamise tehnikast, on nüüd loonud järjestusepaare kloonidest, mis katavad inimese genoomi 11 korda. Ettevõte usub, et 99% inimese genoomist on esindatud kloonitud DNA-s.

Celera kogu genoomi järjestamise strateegiat kinnitas hiljutine Drosophila melanogasteri (puuviljakärbse) genoom, mis on seni suurim järjestatud ja kokku pandud genoom. Drosophila on inimese bioloogia ja meditsiini jaoks väga oluline mudel. Pärast kokkupanekut ja annoteerimist on Drosophila genoomi mittekorduvate piirkondade järjestuse täpsus suurem kui 99,99%.

Celera on lõpetanud inimese genoomi järjestamise faasi ja alustanud genoomi kokkupanemist, kuid ettevõte jätkab inimese sekveneerimist SNP (ühe nukleotiidi polümorfismi) mitmekesisuse ja lünkade sulgemise jaoks. SNP-d on inimestevahelised ühetähelised variatsioonid, mis määravad vastuvõtlikkuse haigustele ja võime haigusega võidelda. Celera inimgenoomi järjestamise lähenemisviisi oluline tunnus on erineva etnilise taustaga meeste ja naiste geneetilise materjali kasutamine. Kui Celera lõpetab järgmise paari kuu jooksul inimese SNP sekveneerimise, koosneb tema genoomiandmebaas kuue erineva etnilise taustaga mehe ja naise andmetest. See lähenemisviis peaks võimaldama Celeral arendada andmebaasi indiviididevaheliste geneetiliste variatsioonide uurimiseks genoomi dešifreerimise ajal. "Nüüd, kui oleme lõpetanud ühe inimese genoomi järjestamise, suuname oma arvutusvõimsuse inimese genoomi järjestamise ülesandeks," ütles J.Craig Venter, Ph.D., Celera president ja juhtivteadur. "Kavatseme täiendada ja avaldada inimandmed kujul, mis on kooskõlas kõrgekvaliteedilise Drosophila genoomiga, mille Celera saavutas koostöös Berkeley Drosophila genoomiprojektiga. Eeldatakse, et see võimaldab teadlastel kogu maailmas ja meie tellijatel kasutada meie andmeid teha olulisi meditsiinilisi edusamme."

Celera alustab hiire genoomiprojekti

Celera on nüüd alustanud hiire genoomi projekti, mis on kriitilise tähtsusega biomeditsiini teadlastele, kes kasutavad hiirt inimese bioloogia ja meditsiini uuringute mudelina. Celera ärimudeli põhifunktsiooniks on võimalus võrrelda erinevate organismide genoome (võrdlev genoomika). Hiire, Drosophila ja inimese genoomide võrdlemine avab eeldatavasti palju uusi võimalusi geenide säilitamise ja reguleerimise mehhanismide uurimiseks, mis võib aidata paremini mõista geenide funktsiooni ja haigusi.

Celera verstapostid

Inimese genoom:

10. jaanuaril 2000 teatas Celera, et on kogunud andmed, mis katavad 90% inimese genoomist. Tänase teadaandega on Celera eesmärk viia lõpule inimgenoomi kokkupanek ja annoteerimine selle aasta lõpus.

Drosophila melanogasteri genoom:

30. detsembril 1999 lõpetas Celera Drosophila genoomi järjestuse avaldamise avalikku andmepanka. Pärast ulatuslikku teaduslikku analüüsi koos Berkeley Drosophila genoomiprojekti (BDGP) ja teiste kaastöötajatega avaldasid Celera ja avalikud kaastöötajad käsikirjad 24. märtsil 2000 teadusajakirjas Science. Celera ja tema kaastöötajad on tuvastanud ligi 14 000 geeni genoomis, paljud kaubanduslikult olulistes valguperekondades, mis peaksid osutuma väärtuslikuks uute ravimite ja insektitsiidide väljatöötamisel. Drosophila on seni suurim järjestatud genoom ning esimene putukas ja esimene kesknärvisüsteemiga organism, mis on järjestatud.

PE Corporation koosneb praegu kahest tegevusgrupist. Celera Genomics Group, mille peakorter asub Rockville'is, MD, kavatseb saada genoomilise ja sellega seotud meditsiinilise teabe lõplikuks allikaks. PE Biosystems Group (NYSE: PEB), mille peakontor asub Kalifornia osariigis Foster Citys ja mille käive oli 1999. aasta eelarveperioodil 1,2 miljardit dollarit, arendab ja turustab bioteaduste tööstusele ja teadusringkondadele instrumendipõhiseid süsteeme, reaktiive, tarkvara ja lepingutega seotud teenuseid. Teave ettevõtte kohta, sealhulgas PE Corporationi konsolideeritud finantsaruanded, on saadaval veebis aadressil http://www.pecorporation.com või telefonil (800) 762-6923.

Populaarne teema