In Silico Cell tuberkuloosiravimite avastamiseks

In Silico Cell tuberkuloosiravimite avastamiseks
In Silico Cell tuberkuloosiravimite avastamiseks
Anonim

Surrey ülikooli teadlaste meeskond on valmis saanud tuberkuloosi põhjustava mikroobi esimese genoomi skaala mudeli. Mudel võib olla väga kasulik tööriist uute ravimite sihtmärkide tuvastamiseks ja uute vaktsiinide kavandamiseks.

Tuberkuloos on tänapäeval üks suurimaid tapjaid maailmas, põhjustades igal aastal ligi kümne miljoni juhtumi ja pooleteise miljoni surmajuhtumi. Tekivad uued tüved, mis on resistentsed kõikide praeguste esirea tuberkuloosivastaste ravimite suhtes, nii et uusi ravimeid on kiiresti vaja. Tuberkuloosibatsilli ainevahetusest teatakse aga vähe ja selle aeglase kasvu tõttu võtavad katsed väga kaua aega.

Surrey grupp loodab kiirendada ravimite avastamise protsessi, luues tuberkuloosi põhjustava aine in silico mudeli: virtuaalse tuberkuloosibatsilli. See mudel koostati patogeeni kogu genoomi järjestuse teabe põhjal ja kasutab matemaatilisi võrrandeid, et modelleerida toitainete voolu läbi raku. Mudel on äärmiselt keeruline, käsitledes 848 erinevat biokeemilist reaktsiooni ja 726 geeni.

Surrey meeskond näitas, et mudel simuleerib eduk alt paljusid tuberkuloosibatsilli omapäraseid omadusi ja tuvastab tuntud tuberkuloosivastaste ravimite sihtmärgid. Kuid erinev alt bioloogilistest organismidest kasvab in silico TB-batsill nanosekundites, nii et katseid, mis tavaliselt kestavad kuid, saab teha minutitega. Rühm loodab, et in silico mudelit saab kasutada uute ravimite sihtmärkide tuvastamiseks, eriti selliste, mis on võimelised tapma püsivaid batsille.

Töö avaldatakse kõrgetasemelises ajakirjas Genome Biology ja see ei kirjelda mitte ainult mudelit, vaid teeb esimest korda interaktiivse veebisaidi kaudu ka in silico mudeli teistele teadlastele kättesaadavaks.Teadlased saavad teha eksperimente virtuaalse tuberkuloosibatsilliga Bombay rannast või Malawi mäetipust. Loodetakse, et selle uudse uurimisvahendi kättesaadavus stimuleerib uusi lähenemisviise selle surmava patogeeni tõrjeks.

Populaarne teema