Vähkirakkude mutatsioonimäärad on tugev alt seotud kromatiini organiseerimisega

Vähkirakkude mutatsioonimäärad on tugev alt seotud kromatiini organiseerimisega
Vähkirakkude mutatsioonimäärad on tugev alt seotud kromatiini organiseerimisega
Anonim

Meie rakkudes on DNA pakitud tihedasse struktuuri, mida nimetatakse kromatiiniks, et rakk saaks paljuneda, parandada raku jagunemise ajal tekkinud DNA kahjustusi ja kontrollida, milliseid geene ekspresseeritakse. Genoomiregulatsiooni keskuse CRG teadlased on leidnud, et kromatiinil on palju pistmist sellega, kus vähirakkude genoomis esinevad mutatsioonid.

Vähki peetakse geneetiliseks haiguseks, mille peamiseks põhjuseks on mitmesugused mutatsioonid, mis tekivad genoomi dubleerimisel rakkude jagunemise ajal. On pakutud palju geneetilisi ja epigeneetilisi tunnuseid, mis mõjutavad genoomis toimuvate mutatsioonide kiirust.CRG teadlased on leidnud, et kromatiini organiseeritus on mutatsioonimääradega kõige tugevam alt seotud omadus, vähem alt vähirakkudes.

Teadlased uurisid proove erinevat tüüpi kudedest ja erinevat tüüpi mutatsioonidega vähirakkudes, nagu leukeemia, melanoom, väike kopsuvähk ja eesnäärmevähk. Nad said andmed genoomi andmebaaside avatud juurdepääsu hoidlate kaudu. Alates esimese genoomi sekveneerimisest peaksid kõik riiklikult rahastatud teadusuuringute genoomiandmed olema nende hoidlate kaudu vab alt kättesaadavad. Paljude teiste huvide hulgas on mitme teadlase juba kogutud andmete kasutamise tugevaks küljeks see, et eelarvamused tühistatakse katsete arvu tõttu.

Peateuurija, ICREA uurimisprofessor Ben Lehner ütleb: "Laimad eksperimendid, nagu vähigenoomiprojektid, tähendavad, et bioloogias on nüüd sageli võimalik katsetada ideed, kasutades juba loodud andmeid.Nende projektide andmeid saavad rühmad üle maailma kasutada selleks, et aidata meil õppida tundma vähi põhjuseid, kuid neid saab kasutada ka mõnede geneetika põhiprobleemide mõistmiseks, näiteks miks mõned genoomi piirkonnad muteeruvad kiiremini kui teised.'

Uuringut rahastasid Euroopa Teadusnõukogu (ERC), EL 7. raamprogrammi projekt 4DCellFate, Hispaania teadus- ja tehnoloogiaministeerium ning Agaur.

Populaarne teema